Technologies de l’Information pour la Santé

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Séance n°1 (14/10/2014):

• Envoi d'un mail aux tuteurs pour prendre rdv
• Recherche sur l'élastographie
• Mise à jour de la page wiki

Séance n°2 (20/10/2014):

• Confirmation du rdv avec le tuteur à l'Hôpital Civil le 22/10
• Documentation sur les bases du Matlab

Séance n°3 (23/10/2014):

• Compte-rendu du rdv avec le tuteur
• Établissement du planning
• Documentation sur la transformée de Fourier discrète
• Lecture des articles envoyés par le tuteur sur l'ERM et le LFE

Séance n°4 (12/11/2014):

• Mise en commun sur l'avancement du Cahier des Charges et du Diagramme de Gantt
• Récapitulatif des articles sur le LFE et l'ERM
• Préparation de la 1ère entrevue: diagrammes FAST, SADT, Bête à cornes…

Rendez-vous du 18/11 (après la 1ère réunion intermédiaire):

• Éclaircissement du sujet et des différents points à aborder dans le projet avec nos tuteurs
• Objectifs fixés pour le prochain RDV : Transformées de Fourier sous Matlab / Possibilité d'applications de filtres

Séance n°5 (24/11/2014):

• Prise en main du logiciel Matlab: Utilisation de la transformée de Fourier

Séances n°6-7-8 (Semaine du 01/12/2014)

• Application de la Commande FFT sous MAtlab à divers signaux
• Tentative d'application de filtres sous Matlab à ces signaux

Rendez-vous du 04/12:

• Mise au point avec le tuteur sur le travail effectué via Matlab

Séances n°9-10-11 du mois de janvier:

• Reprise du PowerPoint afin d'éclaircir les différents points encore flous du sujet.
• Prise de rendez vous avec notre tuteur J. Vappou.

Rendez-vous du 30/01:

• Présentation du sujet afin de reprendre ce qui était resté imprécis lors du premier Bilan.
• Derniers éclaircissements avec le tuteur sur l'ERM et le LFE.

Deuxième Réunion Intermédiaire (avec V. Schuh):

• Bilan: meilleure maîtrise du contexte, ainsi que de l'ensemble du sujet
• Continuer à éclaircir le coeur du projet tout en commençant l'implémentation du programme

Travail du mois de Février:

• Implémentation d'un code de type LFE sous Matlab
• Ci-joint la thèse dont est extraite l'exemple suivi:
  

these_blanchard.pdf

• Script du programme Matlab:
  

erm_-_wiki_-_these_blanchard.pdf

• Résultats obtenus:
  

resultats_blanchard.pdf

Rendez-vous du 06/03:

• Mise au point avec le tuteur sur la présentation n°2

Séance du 8/03/2015:

• Finalisation du diaporama et préparation de la présentation n°2

Séance du 17/03/2015:

• Mise à jour du wiki suite aux recommandations des superviseurs après la réunion bilan n°2

Séances du 23/03/2015 au 25/03/2015:

• Mise à jour du wiki
• Création de l'élastogramme correspondant à l'exemple de Blanchard
• Langage C :
  • Résolution du problème d'importation des matrices d'amplitude et de phase
  • Finalisation des filtres
  • Recherche sur l'implémentation de la Transformée de Fourier
  • Amélioration de la fonction permettant la visualisation de l'élastogramme

Séances du 30/03/2015 au 2/04/2015:

• Langage C :
  • Création des fonctions FFT et IFFT
  • Vérification des résultats de ces dernières en langage C par comparaison avec les valeurs obtenues pour les fonctions fft et ifft de Matlab
  • Adaptation de la fonction permettant la visualisation de l'élastogramme
  • Création du main rassemblant tous les calculs propres à l'algorithme LFE
  • Obtention d'un programme en langage C permettant la visualisation de l'élastogramme caractéristique de l'exemple de la thèse de Blanchard (obtenu précédemment via Matlab)

Séances du 13/04/2015 et 14/04/2015:

• Recherche sur une échelle de couleurs adaptable pour la fonction Elastogramme
• Prise de rdv pour l'entrevue intermédiaire avec V.Schuh
• Mise à jour du diaporama de présentation en vu de l'entrevue intermédiaire avec V.Schuh

Troisième entrevue intermédiaire:

• Présentation de l'avancement du projet
• Bilan: bon avancement de l'implémentation en C - le retard du début d'année a été rattrapé
• Conseils pour la présentation finale

Rendez-vous du 21/04:

• Mise au point avec le tuteur sur le programme 1D en langage C
• Début de la programmation en 2D sur une image réelle

Semaine du 20/04/2015:

• Correction des derniers problèmes du programme 1D en langage C
• Amélioration des fonctions FFT et IFFT afin qu'elles renvoient des tableaux plutôt que des fichiers .txt
• Amélioration de la fonction Elastogramme pour afficher une image 2D
• Modification du main.c (ajout d'une boucle) afin d'obtenir une matrice d'élasticité 128*128

Semaine du 27/04/2015:

• Amélioration de la fonction Elastogramme pour afficher une image en niveaux de gris
• Création de la fonction ElastogrammeColor qui affiche une image disposant d'une échelle de 16 couleurs
• Test d'affichage des matrices d'amplitude et de phase
• Suppression des valeurs infinies apparaissant lors de l'application du LFE aux valeurs nulles de la matrice de phase
• Recherche d'une manière de chronométrer le temps d'exécution du script Matlab et des programmes en langage C

→ Matlab : fonction tic - toc

1. Temps moyen = 612,8 millisecondes en 1D
2. Temps moyen = 881,5 millisecondes en 2D - Script de N.Corbin

→ Langage C : fonction SDL_GetTicks()

1. Temps moyen = 497,5 millisecondes en 1D
2. Temps moyen = 970,3 millisecondes en 2D

Séance du 5/05/2015:

• Mise en commun du travail réalisé durant les vacances
• Préparation de la présentation finale

Rendez-vous du 6/05/2015:

• Présentation finale devant les tuteurs/clients
• Correction de différents points sur les diapositives

Séance du 7/05/2015:

• Correction de la présentation finale
• Mise à jour du Wiki

Séance du 10/05/2015:

• Préparation orale de la présentation finale en prévision du dernier bilan d'avancement ayant lieu le lendemain

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