Technologies de l’Information pour la Santé

16H + 20H de TP

coefficient 2

Cet enseignement vise à acquérir les notions et outils couramment utilisés en traitement des images.

Seront abordés les points suivants :

• Introduction ; Image, Transformées et descripteurs, Descripteurs élémentaires
• Introduction aux problèmes en traitement d'images médicales : recalage, inverse, classification, atlas, format DICOM, stockage
• Logiciels : Medipy, FSL, Slicer, Vrender, ….
• Médecine nucléaire, imagerie IRM : pratique clinique, cérébrale, comas / vieillissement, mémoire, tests cognitifs
• Imagerie de l'abdomen, visualisation
• Descripteurs de formes et transformations 2D (Fourier, Hoteling, Hough, Hadamard, KLT, ACP, DCT, etc.)
• Histogramme et multi-modalités, seuillage automatique, binarisation des images, morphologie mathématiques
• Filtrage et détection de contours, causalité, effets de bord, filtrage 2D, convolution, filtres 2D à réponse impulsionnelle finie standards
• Filtres à réponse impulsionnelle infinie, détection de contours optimale au sens de Canny-Deriche
• Amélioration et restauration d’images, modèles de dégradation, déconvolution et fonction d’appareil
• Recalage et reconstruction
• Classification, méthodes de coalescence (clustering)

Le cours sera illustré directement par des applications sous Matlab, grâce à de très nombreuses questions auxquelles chaque étudiant doit répondre en alternance avec les cours. Cette pratique permet à chaque étudiant d’être confronté très rapidement à la réalité du traitement d’images et d’acquérir les savoir faire qui l’aideront en stage.

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